在云仙火山诞生之前，沉积在海里的沙粒和粘土等地层上，覆盖着来自云仙火山最初期喷火时的堆积物。 它的年代大约是五十万年前。
从地层中含有的轻石来看，我们了解到，最初的云仙火山与现在形成溶岩穹顶式的火山喷发不同，是爆炸式的火山喷发。