據說1496年由有馬貴純建造，別名被稱為「日暮城」的一座美麗城堡。由於「一國一城令」，伴隨著建造島原城，使原城成為廢城。但在1637年爆發了「島原・天草起義」，農民起義軍以原城固守城池。
三面環海圍繞的原城是建在從阿蘇山流過大海的火山碎屑流的堆積面上的。火山碎屑流像為了埋填崎嶇不平的地形而堆積似的，造就了平坦的地形面.這裡的地形平坦可能是建造原城的因素之一吧。附帶說一下，伴隨來自阿蘇山火山碎屑流的火山灰,即使是遙遠的北海道也堆積了約有14釐米的厚度。
2018年，作為「長崎和天草地區的潛伏基督教關聯遺產」的構成資產，被註冊為世界文化遺產。