數千年前的眉山崩塌形成的流山之一森岳。從1618年(元和4年)，松倉重政把這座流山鑿成城堡的形狀，壘上鑿取了石垣，花費7年的歲月在島原城的四周挖城壕築城。建造與身份不相稱的大城堡，加重了領地人民的苛捐雜稅，成為了1637年島原・天草農民起義的原因。在大手門也有叛亂軍的攻防。現在在天守閣展示著與天主教有關的史料和藩政時代的鄉土資料・民俗資料等。