約150～200ｍの落差で古期雲仙火山の堆積層（50万年～30万年前）を切っています。国道側の谷を見ると断層の右側（南側）に古期雲仙火山が、左側（北側）に中期雲仙火山の堆積物（30万年～15万年前）が分布しています。火山噴火を続けながら雲仙地溝帯は沈降し続けるので、金浜断層より南側には中期雲仙火山の堆積物は見られません。